幽冥女王之兄阿達武士（Rito）加入侵略地球的隊伍，並壓倒性的擊敗金剛戰士，摧毀了大連王與戰鬥白虎，指揮中心亦在戰鬥中損毀，金剛戰士就此失去超異能。宙威利用中心所餘的能量，將失去超異能的戰士們送去忍者神廟，要他們去見可製造超異能硬幣的忍者戰士（Ninjor）。儘管途中有阿達武士派遣的食人鳥追擊，但戰士們依舊成功抵達神廟獲得新的超異能，並多了忍者裝扮的變身型態，以及忍者機械獸（Ninja Zords）。後來巴布猴、怪頭陀與魚匠人等尋獲失落已久的無敵戰將（Shogun Zords），玄冥大帝等人遂奪走小晴的超異能硬幣與大明的戰鬥鷹，企圖要脅金剛戰士替自己駕駛無敵戰將征服地球。大明只得潛入暗月宮內，於千鈞一髮之際奪回硬幣與戰鬥鷹，而比利亦在操縱無敵戰將時將控制權奪來，令玄冥大帝的企圖失敗，也讓金剛戰士多了五架新的生力軍。
小晴為了追求理想，決定離開參加體操大賽訓練，原先遭幽冥女王下咒以企圖謀害金剛戰士的凱特（Katherine），在破除魔咒後取代她成為新的粉紅戰士。但過沒多久，幽冥女王的父親終極魔王發動魔法將時間倒轉，令金剛戰士全回到童年時期，因此失去了超異能。為了抵禦侵略，宙威自水柔星請來了外星戰士，第三季就此進入特別篇。至於變回兒童的各戰士，除了比利透過機器很快恢復之外，其餘人則到各地尋找奇奧水晶的碎片，希望將之收集後發動魔力令地球恢復原狀。而伊莎到非洲尋找水晶時，意外與遠親相逢，從此留在當地，由表姊唐娜帶著水晶回到美國。但當水晶湊齊讓地球復原後，天狼將軍（Goldar）與阿達卻闖入指揮中心竊走水晶並炸毀該處，金剛戰士的歷史劃下句點，《異星戰士》開始。
克里斯·帕拉特 安雅·泰勒-乔伊 查理·戴 杰克·布莱克 布丽·拉尔森 唐纳德·格洛弗 本·萨弗迪 科甘-迈克尔·凯 凯文·迈克尔·理查德森 路易斯·古兹曼 伊萨·雷 格伦·鲍威尔 萝珊娜·奥德嘉
欧文·威尔逊 保罗·纽曼 邦尼·亨特 王牌接线员拉里 切奇·马林 托尼·夏尔赫布 盖多·克隆尼 詹妮弗·路易斯 保罗·杜利 迈克尔·沃利斯 乔治·卡林 凯瑟琳·海蒙德 约翰·拉岑贝格 乔·兰福特 迈克尔·基顿 伊迪·麦克勒格 安德鲁·斯坦顿 小戴尔·恩哈特 迈克尔·舒马赫 杰·雷诺 乔纳斯·里维拉 卢·罗曼诺 艾丽莎·奈特 林赛·柯林斯